São 64 equipes jogando sempre em sistema de eliminatórias com partidas de ida e volta. Nas duas primeiras fases quem vencer por dois ou mais gols de diferença, fora de casa, no jogo de ida, garante a vaga na fase seguinte sem o jogo de volta. Nas fases seguintes sempre será necessária a segunda partida para se definir os clubes classificados. Participam neste ano os campeões estaduais, os clubes melhores colocados em seus Estados, além de algumas vagas definidas pelas Federações locais. Os clubes que representam o País na Libertadores ficam de fora desta edição: Corinthians, Internacional, Goiás, Palmeiras, Paulista (campeão da Copa do Brasil 2005) e São Paulo (Campeão da Libertadores 2005).
CRITÉRIOS DE DESEMPATE:
1-Maior saldo de gols após as duas partidas;
2-Maior nº de gols marcados no campo do adversário;
3-Cobranças de pênaltis; não haverá prorrogação.
